Do không đồng ý hợp tác với Việt Minh, vào năm 1954, Võ sư Nguyễn Lộc cùng một số môn đệ thân tín di cư từ miền Bắc vào Nam, sau khi Hồ Chí Minh sai một đệ tử của Vovinam đã đi theo Việt Minh đến ám sát ông, người môn đệ này, vào phút chót không thể làm việc phản sư này được nên đã thú nhận cho ông biết và hối thúc ông nên bỏ đi. Sau vụ ám sát hụt này, ông và các môn đệ về nương náu tại giáo xứ Bùi Chu và Phát Diệm một thời gian trước khi di cư vào Nam. Đây là một bí sử của môn phái Vovinam đã được các môn sinh Vovinam đề cập đến nhiều lần trước năm 1975 trên nhiều sách báo tại miền Nam Việt Nam và được Chưởng môn hiện nay là võ sư Lê Sáng công nhân.
Cùng với việc trên bọn cộng sản tiếp tục gây ra các tội ác trời không dung, đất không tha với các võ sư trưởng môn phái Vovinam sau:
-Trưởng môn Lê Sáng bị cải tạo 13 năm tại trại Xuân Lộc đến Tết năm 1988 mới được tha.
-Võ sư Trần Huy Phong - Tổng cục trưởng Tổng cục huấn luyện Quân Lực Việt Nam Cộng Hòa đi cải tạo 5 năm
